此次重新修撰仅用时八个月，在永乐元年（公元1403年）六月便修撰完成。但在这么短的时间内修撰完成，内容可想而知，史称这个版本的实录是急于求成，所以质量堪忧。不过朱棣当时急于证明自己的合法地位对此也没有表示不满，反而对这个版本的实录大加称赞。然而过了八年之后，朱棣发现了这个版本的问题，并且很有可能这个版本没有充分证明其继位的合法性。因为朱棣在下令第三次修撰《明太祖实录》时，曾公开指责第二个版本的监修官李景隆等人“心术不正”。第三次修撰耗时将近七年，从永乐九年（公元1411年）开始到永乐十六年（公元1418年）结束，正所谓“慢工出细活”，因此朱棣对于此次修撰完成的《明太祖实录》十分满意，史称“披阅良久，嘉奖再四”，并称这个版本的实录很符合朱棣的心意。
说了这么久朱棣的证明行动，可见朱棣抹黑建文帝一系可谓是想尽办法、不遗余力。以至于有人认为朱棣继位后的所作所为都是为了证明自己更适合当皇帝，比如有人认为朱棣在位的时侯的几次北伐和组织编纂《永乐大典》都是朱棣为塑造自己继位的合法性而采取的措施，朱棣想利用这些来证明自己比朱允炆做得更好，更适合做皇帝。这里就要稍微为朱棣鸣个不平了，因为这种看法实际上是有点牵强附会了，因为朱允炆只做了四年的皇帝，如果他能继续做下去最终会有一个什么样的结果，谁都不能给出一个肯定的答复。也因此他和朱棣在做皇帝这件事上根本没有可比性，所以不能因为朱棣是起兵夺位的缘故，就把朱棣在位期间所做的所有事情都想当然的看作是朱棣在塑造自己继位的合法性。