【古斯塔夫二世入侵日耳曼】当旧教徒正在三十年战争中战胜新教徒时，瑞典国王古斯塔夫二世忽然带领军队南侵日耳曼，他一面想解放日耳曼境内的新教徒，一面亦想在日耳曼境内得到一块领土。他在莱比锡（Leipzig）附近果然大败日耳曼旧教同盟的军队。此时华伦斯坦再行招募新军，于1632年和瑞典国王大战于吕岑（Lützen），瑞典军又大胜日耳曼军。但是古斯塔夫二世却因为深入敌军战线，竟为敌兵所杀。不过瑞典的军队并没有撤退，仍旧在日耳曼境内到处骚扰。至于以残忍著称的华伦斯坦亦于1634年被部下刺死。
【黎塞留的加入】此次战争到此本可以结束了，但是法国名相黎塞留为扩张法国的势力，竟又派遣法国军队前往日耳曼和哈布斯堡族的皇帝为难，于是1635年时战端重起。法国、瑞典、西班牙和日耳曼的军队因此又纷争了十余年，日耳曼的元气因之更是大受损伤。
【威斯特伐利亚和约】参加这次战争的人很多，他们的目的又各不相同且互相冲突，所以和约的缔结非常困难。各国的代表差不多磋商了四年之久，才于1648年在威斯特伐利亚签订和约。和约中规定奥格斯堡和约中所特许的信教自由，应该包括日耳曼境内的加尔文派。凡新教诸侯在1624年以前所占有的领土均得照旧保留，各邦的宗教亦仍由各邦君主自行决定。日耳曼境内各邦都得和境内或境外的各国缔结条约，这种规定实际上把神圣罗马帝国解散了。日耳曼北境的一部分地方割给瑞典，不过在名义上仍旧为日耳曼帝国的一部分，因为瑞典此后在日耳曼公会中享有三个表决权。日耳曼皇帝把梅斯（Metz）、凡尔登（Verdun）、图勒（Toul）和阿尔萨斯（Alsace）的权利割让于法国。最后和约中正式承认荷兰和瑞士的独立。